Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGCGQ13326 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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