Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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CALCOCO2Q13137 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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CALCOCO2Q13137 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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CALCOCO2Q13137 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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CALCOCO2Q13137 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
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