Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RESTQ13127 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RESTQ13127 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RESTQ13127 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RESTQ13127 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RESTQ13127 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RESTQ13127 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RESTQ13127 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RESTQ13127 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RESTQ13127 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RESTQ13127 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RESTQ13127 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RESTQ13127 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RESTQ13127 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RESTQ13127 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RESTQ13127 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RESTQ13127 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RESTQ13127 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RESTQ13127 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RESTQ13127 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RESTQ13127 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RESTQ13127 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RESTQ13127 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RESTQ13127 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RESTQ13127 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RESTQ13127 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RESTQ13127 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RESTQ13127 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RESTQ13127 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RESTQ13127 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RESTQ13127 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RESTQ13127 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RESTQ13127 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RESTQ13127 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RESTQ13127 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RESTQ13127 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RESTQ13127 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RESTQ13127 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RESTQ13127 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RESTQ13127 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RESTQ13127 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RESTQ13127 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RESTQ13127 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RESTQ13127 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RESTQ13127 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RESTQ13127 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RESTQ13127 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RESTQ13127 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RESTQ13127 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RESTQ13127 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RESTQ13127 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RESTQ13127 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RESTQ13127 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RESTQ13127 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RESTQ13127 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RESTQ13127 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RESTQ13127 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RESTQ13127 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RESTQ13127 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RESTQ13127 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RESTQ13127 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RESTQ13127 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RESTQ13127 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RESTQ13127 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RESTQ13127 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RESTQ13127 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RESTQ13127 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RESTQ13127 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RESTQ13127 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RESTQ13127 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RESTQ13127 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RESTQ13127 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RESTQ13127 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms