Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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