Protein–RNA interactions for Protein: Q12386

ARP8, Actin-like protein ARP8, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 881 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ARP8Q12386 MET10YFR030W 3108 nt4.75□□□□□ -1.65
ARP8Q12386 EXO84YBR102C 2262 nt4.75□□□□□ -1.65
ARP8Q12386 SNF2YOR290C 5112 nt4.74□□□□□ -1.65
ARP8Q12386 RPN2YIL075C 2838 nt4.74□□□□□ -1.65
ARP8Q12386 GSC2YGR032W 5688 nt4.74□□□□□ -1.65
ARP8Q12386 RDN5-1RDN5-1 121 nt4.74□□□□□ -1.65
ARP8Q12386 RDN5-6RDN5-6 121 nt4.74□□□□□ -1.65
ARP8Q12386 NAB3YPL190C 2409 nt4.74□□□□□ -1.65
ARP8Q12386 VPS3YDR495C 3036 nt4.73□□□□□ -1.65
ARP8Q12386 VPS35YJL154C 2835 nt4.72□□□□□ -1.65
ARP8Q12386 TIM11YDR322C-A 291 nt4.72□□□□□ -1.65
ARP8Q12386 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt4.72□□□□□ -1.65
ARP8Q12386 FAR1YJL157C 2493 nt4.72□□□□□ -1.65
ARP8Q12386 SPO75YLL005C 2607 nt4.72□□□□□ -1.65
ARP8Q12386 VPH1YOR270C 2523 nt4.72□□□□□ -1.65
ARP8Q12386 ZRG17YNR039C 1818 nt4.72□□□□□ -1.65
ARP8Q12386 RIA1YNL163C 3333 nt4.71□□□□□ -1.66
ARP8Q12386 JEN1YKL217W 1851 nt4.71□□□□□ -1.66
ARP8Q12386 NIP100YPL174C 2607 nt4.7□□□□□ -1.66
ARP8Q12386 YBR174CYBR174C 315 nt4.7□□□□□ -1.66
ARP8Q12386 DIP2YLR129W 2832 nt4.7□□□□□ -1.66
ARP8Q12386 PRP22YER013W 3438 nt4.7□□□□□ -1.66
ARP8Q12386 ERB1YMR049C 2424 nt4.7□□□□□ -1.66
ARP8Q12386 MSK1YNL073W 1731 nt4.69□□□□□ -1.66
ARP8Q12386 PFF1YBR074W 2931 nt4.69□□□□□ -1.66
ARP8Q12386 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt4.69□□□□□ -1.66
ARP8Q12386 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt4.69□□□□□ -1.66
ARP8Q12386 YGR051CYGR051C 324 nt4.69□□□□□ -1.66
ARP8Q12386 YLR282CYLR282C 342 nt4.69□□□□□ -1.66
ARP8Q12386 SOK1YDR006C 2706 nt4.69□□□□□ -1.66
ARP8Q12386 SEC15YGL233W 2733 nt4.69□□□□□ -1.66
ARP8Q12386 EMC1YCL045C 2283 nt4.69□□□□□ -1.66
ARP8Q12386 SPC105YGL093W 2754 nt4.68□□□□□ -1.66
ARP8Q12386 VPS34YLR240W 2628 nt4.68□□□□□ -1.66
ARP8Q12386 RSN1YMR266W 2862 nt4.67□□□□□ -1.66
ARP8Q12386 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt4.67□□□□□ -1.66
ARP8Q12386 COS111YBR203W 2775 nt4.67□□□□□ -1.66
ARP8Q12386 PXA2YKL188C 2562 nt4.67□□□□□ -1.66
ARP8Q12386 MCD4YKL165C 2760 nt4.67□□□□□ -1.66
ARP8Q12386 OSH2YDL019C 3852 nt4.67□□□□□ -1.66
ARP8Q12386 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt4.66□□□□□ -1.66
ARP8Q12386 NTO1YPR031W 2247 nt4.65□□□□□ -1.66 RIP-Chip
ARP8Q12386 GIS4YML006C 2325 nt4.65□□□□□ -1.66 RIP-Chip
ARP8Q12386 YGR050CYGR050C 357 nt4.65□□□□□ -1.67
ARP8Q12386 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt4.65□□□□□ -1.67
ARP8Q12386 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt4.65□□□□□ -1.67
ARP8Q12386 snR43snR43 209 nt4.65□□□□□ -1.67
ARP8Q12386 XRN1YGL173C 4587 nt4.65□□□□□ -1.67
ARP8Q12386 TMA108YIL137C 2841 nt4.64□□□□□ -1.67
ARP8Q12386 YLR149CYLR149C 2193 nt4.64□□□□□ -1.67
ARP8Q12386 EMP24YGL200C 612 nt4.64□□□□□ -1.67
ARP8Q12386 RPO21YDL140C 5202 nt4.64□□□□□ -1.67
ARP8Q12386 NCA2YPR155C 1851 nt4.63□□□□□ -1.67 RIP-Chip
ARP8Q12386 PAA1YDR071C 576 nt4.63□□□□□ -1.67
ARP8Q12386 YNL211CYNL211C 261 nt4.63□□□□□ -1.67
ARP8Q12386 PMC1YGL006W 3522 nt4.63□□□□□ -1.67
ARP8Q12386 BOI1YBL085W 2943 nt4.62□□□□□ -1.67
ARP8Q12386 TCB3YML072C 4638 nt4.62□□□□□ -1.67
ARP8Q12386 ARO80YDR421W 2853 nt4.62□□□□□ -1.67
ARP8Q12386 ELG1YOR144C 2376 nt4.61□□□□□ -1.67
ARP8Q12386 SKG6YHR149C 2205 nt4.6□□□□□ -1.67 RIP-Chip
ARP8Q12386 GRR1YJR090C 3456 nt4.6□□□□□ -1.67 RIP-Chip
ARP8Q12386 SEF1YBL066C 3447 nt4.6□□□□□ -1.67
ARP8Q12386 YDL196WYDL196W 330 nt4.59□□□□□ -1.67
ARP8Q12386 HYP2YEL034W 474 nt4.59□□□□□ -1.67
ARP8Q12386 IES6YEL044W 501 nt4.59□□□□□ -1.67
ARP8Q12386 TAF6YGL112C 1551 nt4.59□□□□□ -1.67
ARP8Q12386 RPL22AYLR061W 366 nt4.59□□□□□ -1.67
ARP8Q12386 APL5YPL195W 2799 nt4.59□□□□□ -1.68 RIP-Chip
ARP8Q12386 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt4.58□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt4.58□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt4.58□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt4.58□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt4.58□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 YCL019WYCL019W 5313 nt4.58□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt4.58□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt4.58□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 SPC98YNL126W 2541 nt4.58□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 SEG1YMR086W 2883 nt4.58□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 ITC1YGL133W 3795 nt4.58□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 PEP3YLR148W 2757 nt4.58□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 ORC1YML065W 2745 nt4.58□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 FAS1YKL182W 6156 nt4.57□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 MYO5YMR109W 3660 nt4.57□□□□□ -1.68 RIP-Chip
ARP8Q12386 PSK2YOL045W 3306 nt4.56□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 YAT2YER024W 2772 nt4.56□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 OST4YDL232W 111 nt4.56□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt4.55□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 YIL174WYIL174W 228 nt4.55□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt4.55□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 ATG13YPR185W 2217 nt4.55□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 TCO89YPL180W 2400 nt4.55□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 ATP7YKL016C 525 nt4.54□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt4.54□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 YNR065CYNR065C 3351 nt4.54□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 ATG11YPR049C 3537 nt4.53□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 KAP95YLR347C 2586 nt4.53□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 YDR239CYDR239C 2364 nt4.53□□□□□ -1.68
ARP8Q12386 HOS3YPL116W 2094 nt4.52□□□□□ -1.69
ARP8Q12386 VAC7YNL054W 3498 nt4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.7 ms