Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 GIC2YDR309C 1152 nt0.57□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 YER046W-AYER046W-A 330 nt0.57□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 RTR1YER139C 681 nt0.57□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 ISF1YMR081C 1017 nt0.57□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 HHT1YBR010W 411 nt0.57□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt0.57□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 NSL1YPL233W 651 nt0.57□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 MUD2YKL074C 1584 nt0.57□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 NUR1YDL089W 1455 nt0.56□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 RKR1YMR247C 4689 nt0.56□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.56□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 URM1YIL008W 300 nt0.56□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 YAL064WYAL064W 285 nt0.56□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 PGA1YNL158W 597 nt0.56□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 ATX1YNL259C 222 nt0.56□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 TIM18YOR297C 579 nt0.56□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 KAR9YPL269W 1935 nt0.56□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 YML002WYML002W 2214 nt0.56□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 TSA2YDR453C 591 nt0.55□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 YIR020CYIR020C 303 nt0.55□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 RPL40BYKR094C 387 nt0.55□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 RIO2YNL207W 1278 nt0.55□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 TMA20YER007C-A 546 nt0.54□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 COG7YGL005C 840 nt0.54□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 YJL032WYJL032W 315 nt0.54□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt0.54□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 GRX8YLR364W 330 nt0.54□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 ATP18YML081C-A 180 nt0.54□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 FAR3YMR052W 615 nt0.54□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.54□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 GPI2YPL076W 843 nt0.54□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 SPP381YBR152W 876 nt0.54□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 SET3YKR029C 2256 nt0.53□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 SEC5YDR166C 2916 nt0.53□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 BTN2YGR142W 1233 nt0.53□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 PPE1YHR075C 1203 nt0.53□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt0.53□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 YBL073WYBL073W 312 nt0.53□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 ERV15YBR210W 429 nt0.53□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 SLU7YDR088C 1149 nt0.52□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 YDR290WYDR290W 330 nt0.52□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 WIP1YDR374W-A 270 nt0.52□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 YGL217CYGL217C 342 nt0.52□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 GOS1YHL031C 672 nt0.52□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 SPO13YHR014W 876 nt0.52□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 COX6YHR051W 447 nt0.52□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 YLR458WYLR458W 381 nt0.52□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 AIM9YER080W 1884 nt0.52□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 YCR043CYCR043C 384 nt0.51□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 SWI4YER111C 3282 nt0.51□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 UTP10YJL109C 5310 nt0.51□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 SLX4YLR135W 2247 nt0.51□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 YPR142CYPR142C 564 nt0.51□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 LDH1YBR204C 1128 nt0.51□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 RPC25YKL144C 639 nt0.5□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 SWS2YNL081C 432 nt0.5□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 YBP2YGL060W 1926 nt0.5□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 YDR248CYDR248C 582 nt0.49□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 VMA7YGR020C 357 nt0.49□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 YNL010WYNL010W 726 nt0.49□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt0.49□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 YOR218CYOR218C 420 nt0.49□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 SWI6YLR182W 2412 nt0.48□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 SWT1YOR166C 1377 nt0.48□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 MZM1YDR493W 372 nt0.48□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 YBL083CYBL083C 426 nt0.48□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 RRP15YPR143W 753 nt0.48□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 UTP13YLR222C 2454 nt0.48□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 GDS1YOR355W 1569 nt0.48□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 GEA2YEL022W 4380 nt0.48□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 RSM28YDR494W 1086 nt0.47□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.47□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 SMD3YLR147C 306 nt0.47□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 NEJ1YLR265C 1029 nt0.47□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 SEC22YLR268W 645 nt0.47□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 BRX1YOL077C 876 nt0.47□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 SFG1YOR315W 1041 nt0.47□□□□□ -2.33
RTR2Q12378 LAG1YHL003C 1236 nt0.46□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 ABM1YJR108W 372 nt0.46□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 YLL054CYLL054C 2532 nt0.46□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 YDL073WYDL073W 2955 nt0.45□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 SMB1YER029C 591 nt0.45□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 TRS65YGR166W 1683 nt0.45□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 OSH6YKR003W 1347 nt0.44□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 YCR016WYCR016W 873 nt0.44□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 PRM8YGL053W 714 nt0.44□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 HYM1YKL189W 1200 nt0.44□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 RPL38YLR325C 237 nt0.44□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 UBC7YMR022W 498 nt0.44□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 FIG4YNL325C 2640 nt0.43□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 SLD5YDR489W 885 nt0.43□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 CYC7YEL039C 342 nt0.43□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt0.43□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 RCN1YKL159C 636 nt0.43□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 YMR178WYMR178W 825 nt0.43□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 NOT5YPR072W 1683 nt0.43□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 SPT21YMR179W 2277 nt0.43□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 SGO1YOR073W 1773 nt0.42□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 YOL024WYOL024W 519 nt0.42□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 YOL150CYOL150C 312 nt0.42□□□□□ -2.34
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