Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 BPH1YCR032W 6504 nt1.86□□□□□ -2.11
LDB17Q12342 MYO4YAL029C 4416 nt1.86□□□□□ -2.11
LDB17Q12342 NAM7YMR080C 2916 nt1.85□□□□□ -2.11
LDB17Q12342 RTR2YDR066C 591 nt1.85□□□□□ -2.11
LDB17Q12342 BI2Q0110 1272 nt1.85□□□□□ -2.11
LDB17Q12342 NOP10YHR072W-A 177 nt1.85□□□□□ -2.11
LDB17Q12342 TEN1YLR010C 483 nt1.85□□□□□ -2.11
LDB17Q12342 YLR053CYLR053C 327 nt1.85□□□□□ -2.11
LDB17Q12342 YLR269CYLR269C 351 nt1.85□□□□□ -2.11
LDB17Q12342 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt1.85□□□□□ -2.11
LDB17Q12342 MGR1YCL044C 1254 nt1.85□□□□□ -2.11
LDB17Q12342 BFA1YJR053W 1725 nt1.85□□□□□ -2.11
LDB17Q12342 RNH70YGR276C 1662 nt1.84□□□□□ -2.11
LDB17Q12342 SYH1YPL105C 2550 nt1.84□□□□□ -2.11
LDB17Q12342 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt1.84□□□□□ -2.11
LDB17Q12342 RPI1YIL119C 1224 nt1.84□□□□□ -2.11
LDB17Q12342 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt1.84□□□□□ -2.11
LDB17Q12342 RPL37AYLR185W 267 nt1.84□□□□□ -2.11
LDB17Q12342 COX7YMR256C 183 nt1.84□□□□□ -2.11
LDB17Q12342 SPC29YPL124W 762 nt1.84□□□□□ -2.11
LDB17Q12342 DFG16YOR030W 1860 nt1.84□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 SMB1YER029C 591 nt1.83□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 YER068C-AYER068C-A 432 nt1.83□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 YLR171WYLR171W 390 nt1.83□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt1.83□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 snR41snR41 95 nt1.83□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.83□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 HSH155YMR288W 2916 nt1.82□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 VPS52YDR484W 1926 nt1.82□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 HOP2YGL033W 657 nt1.82□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 VAR1Q0140 1197 nt1.82□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 SMD1YGR074W 441 nt1.82□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 SEN15YMR059W 387 nt1.82□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 CDC33YOL139C 642 nt1.82□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 YOR248WYOR248W 303 nt1.82□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 ROX1YPR065W 1107 nt1.82□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 UBP1YDL122W 2430 nt1.81□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 YER188C-AYER188C-A 300 nt1.81□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt1.81□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt1.81□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 CRG1YHR209W 876 nt1.81□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt1.81□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 GRX8YLR364W 330 nt1.81□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 YML108WYML108W 318 nt1.81□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 CMC2YBL059C-A 330 nt1.81□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 NOP15YNL110C 663 nt1.81□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 EGD1YPL037C 474 nt1.81□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 SPC72YAL047C 1869 nt1.8□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 SPO22YIL073C 2928 nt1.8□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.8□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 YDL068WYDL068W 330 nt1.8□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 CAJ1YER048C 1176 nt1.8□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 YER135CYER135C 393 nt1.8□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 HUR1YGL168W 333 nt1.8□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 BIG1YHR101C 1008 nt1.8□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 YHR130CYHR130C 336 nt1.8□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 RTC6YPL183W-A 282 nt1.8□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 YPR177CYPR177C 372 nt1.8□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 UTP21YLR409C 2820 nt1.8□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 LRE1YCL051W 1752 nt1.8□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 YNL144CYNL144C 2223 nt1.79□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 SOK2YMR016C 2358 nt1.79□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 VPS34YLR240W 2628 nt1.79□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 STB4YMR019W 2850 nt1.79□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 RTP1YMR185W 2946 nt1.79□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 YDL041WYDL041W 354 nt1.79□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 YKL111CYKL111C 336 nt1.79□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt1.79□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt1.79□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt1.79□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt1.79□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 VMR1YHL035C 4779 nt1.79□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 PEX8YGR077C 1770 nt1.78□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 YGR025WYGR025W 303 nt1.78□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 VOA1YGR106C 798 nt1.78□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 LSO2YGR169C-A 279 nt1.78□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 FYV12YOR183W 390 nt1.78□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 YPR039WYPR039W 336 nt1.78□□□□□ -2.12
LDB17Q12342 PPN1YDR452W 2025 nt1.78□□□□□ -2.13
LDB17Q12342 YDL062WYDL062W 426 nt1.77□□□□□ -2.13
LDB17Q12342 YHR210CYHR210C 1026 nt1.77□□□□□ -2.13
LDB17Q12342 YJL007CYJL007C 315 nt1.77□□□□□ -2.13
LDB17Q12342 TIF11YMR260C 462 nt1.77□□□□□ -2.13
LDB17Q12342 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt1.77□□□□□ -2.13
LDB17Q12342 YPL205CYPL205C 345 nt1.77□□□□□ -2.13
LDB17Q12342 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt1.77□□□□□ -2.13
LDB17Q12342 PKH3YDR466W 2697 nt1.77□□□□□ -2.13
LDB17Q12342 CRM1YGR218W 3255 nt1.77□□□□□ -2.13
LDB17Q12342 IRC10YOL015W 1761 nt1.77□□□□□ -2.13
LDB17Q12342 VPS15YBR097W 4365 nt1.77□□□□□ -2.13
LDB17Q12342 VPS35YJL154C 2835 nt1.76□□□□□ -2.13
LDB17Q12342 PAU3YCR104W 375 nt1.76□□□□□ -2.13
LDB17Q12342 YLR101CYLR101C 396 nt1.76□□□□□ -2.13
LDB17Q12342 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.76□□□□□ -2.13
LDB17Q12342 PRM3YPL192C 402 nt1.76□□□□□ -2.13
LDB17Q12342 SLM6YBR266C 453 nt1.76□□□□□ -2.13
LDB17Q12342 NUP120YKL057C 3114 nt1.76□□□□□ -2.13
LDB17Q12342 GDS1YOR355W 1569 nt1.76□□□□□ -2.13
LDB17Q12342 HMLALPHA2YCL067C 633 nt1.75□□□□□ -2.13
LDB17Q12342 MATALPHA2YCR039C 633 nt1.75□□□□□ -2.13
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