Protein–RNA interactions for Protein: Q12186

MSL5, Branchpoint-bridging protein, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 476 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSL5	Q12186	snR70	snR70	164 nt		2.7	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	YLR140W	YLR140W	327 nt		2.7	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	RPL36A	YMR194W	303 nt		2.7	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	GIS2	YNL255C	462 nt		2.7	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	TRM7	YBR061C	933 nt		2.7	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	YPR203W	YPR203W	309 nt		2.7	□□□□□ -1.98	RIP-Chip
MSL5	Q12186	ROG1	YGL144C	2058 nt		2.7	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	YDR034C-D	YDR034C-D	5313 nt		2.7	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	YPR022C	YPR022C	3402 nt		2.7	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	PSY2	YNL201C	2577 nt		2.69	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	NET1	YJL076W	3570 nt		2.69	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	RPS27A	YKL156W	249 nt		2.69	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	AUS1	YOR011W	4185 nt		2.69	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	COG3	YER157W	2406 nt		2.69	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	DIA2	YOR080W	2199 nt		2.68	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	STT4	YLR305C	5703 nt		2.68	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	CIN8	YEL061C	3003 nt		2.68	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	RBK1	YCR036W	1002 nt		2.68	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	OLI1	Q0130	231 nt		2.68	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	LSO2	YGR169C-A	279 nt		2.68	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	tQ(UUG)B	tQ(UUG)B	72 nt		2.68	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	AYR1	YIL124W	894 nt		2.68	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	YMR172C-A	YMR172C-A	384 nt		2.68	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	DSE4	YNR067C	3354 nt		2.68	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	YGR250C	YGR250C	2346 nt		2.67	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	YGR164W	YGR164W	336 nt		2.67	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	YJL222W-B	YJL222W-B	138 nt		2.67	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	RPL20A	YMR242C	519 nt		2.67	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	MRPL33	YMR286W	261 nt		2.67	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	YMR321C	YMR321C	318 nt		2.67	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	YMR324C	YMR324C	243 nt		2.67	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	YNL010W	YNL010W	726 nt		2.67	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	HHT1	YBR010W	411 nt		2.67	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	VTC4	YJL012C	2166 nt		2.67	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	CHO2	YGR157W	2610 nt		2.66	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	YER121W	YER121W	345 nt		2.66	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	VPS55	YJR044C	423 nt		2.66	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	YBL083C	YBL083C	426 nt		2.66	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	YPR063C	YPR063C	423 nt		2.66	□□□□□ -1.98	RIP-Chip
MSL5	Q12186	SSE1	YPL106C	2082 nt		2.65	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	YEL025C	YEL025C	3567 nt		2.65	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	HDA3	YPR179C	1968 nt		2.65	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	FLO11	YIR019C	4104 nt		2.65	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	FUN30	YAL019W	3396 nt		2.65	□□□□□ -1.98
MSL5	Q12186	CAF120	YNL278W	3183 nt		2.65	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	MET5	YJR137C	4329 nt		2.65	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	NPC2	YDL046W	522 nt		2.65	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	PHD1	YKL043W	1101 nt		2.65	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	YNL028W	YNL028W	318 nt		2.65	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	SPO14	YKR031C	5052 nt		2.65	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	GCD6	YDR211W	2139 nt		2.64	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	tF(GAA)Q	tF(GAA)Q	75 nt		2.64	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	YER189W	YER189W	369 nt		2.64	□□□□□ -1.99	RIP-Chip
MSL5	Q12186	UTP14	YML093W	2700 nt		2.64	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	SNU114	YKL173W	3027 nt		2.64	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	ECM21	YBL101C	3354 nt		2.64	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	QCR7	YDR529C	384 nt		2.63	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	RPL25	YOL127W	429 nt		2.63	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	IKI3	YLR384C	4050 nt		2.63	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	DNA2	YHR164C	4569 nt		2.63	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	YHR086W-A	YHR086W-A	162 nt		2.62	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	YIL059C	YIL059C	366 nt		2.62	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	PCC1	YKR095W-A	267 nt		2.62	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	COF1	YLL050C	432 nt		2.62	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	LCL2	YLR104W	396 nt		2.62	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	CSE2	YNR010W	450 nt		2.62	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	YOR015W	YOR015W	360 nt		2.62	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	YDR210W-B	YDR210W-B	5313 nt		2.61	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	YDR261W-B	YDR261W-B	5313 nt		2.61	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	YFL002W-A	YFL002W-A	5313 nt		2.61	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	YGR161W-B	YGR161W-B	5313 nt		2.61	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	YLR410W-B	YLR410W-B	5313 nt		2.61	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	YCL019W	YCL019W	5313 nt		2.61	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	KAR3	YPR141C	2190 nt		2.61	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	AI2	Q0055	2565 nt		2.61	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	GCN1	YGL195W	8019 nt		2.61	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	PSK2	YOL045W	3306 nt		2.61	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	MIT1	YEL007W	2001 nt		2.61	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	APC2	YLR127C	2562 nt		2.6	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	PHO2	YDL106C	1680 nt		2.6	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	NFT1	YKR103W	3657 nt		2.6	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	YDR426C	YDR426C	378 nt		2.6	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	YLR120W-A	YLR120W-A	102 nt		2.6	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	YLR154W-E	YLR154W-E	204 nt		2.6	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	UPS1	YLR193C	528 nt		2.6	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	RPL20B	YOR312C	519 nt		2.6	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	AI5_ALPHA	Q0070	1893 nt		2.6	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	TOR1	YJR066W	7413 nt		2.59	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	SPB1	YCL054W	2526 nt		2.59	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	FAP7	YDL166C	594 nt		2.59	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	YMR31	YFR049W	372 nt		2.59	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	YGL024W	YGL024W	336 nt		2.59	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	RAM2	YKL019W	951 nt		2.59	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	YBR178W	YBR178W	375 nt		2.59	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	RIF1	YBR275C	5751 nt		2.59	□□□□□ -1.99
MSL5	Q12186	HEH2	YDR458C	1992 nt		2.59	□□□□□ -2
MSL5	Q12186	SSM4	YIL030C	3960 nt		2.59	□□□□□ -2
MSL5	Q12186	DIS3	YOL021C	3006 nt		2.59	□□□□□ -2
MSL5	Q12186	RGR1	YLR071C	3249 nt		2.59	□□□□□ -2
MSL5	Q12186	CDC20	YGL116W	1833 nt		2.58	□□□□□ -2

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