Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms