Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms