Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DHX9Q08211 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms