Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms