Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4BQ07343 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms