Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms