Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms