Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELQ04864 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELQ04864 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELQ04864 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELQ04864 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELQ04864 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELQ04864 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELQ04864 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELQ04864 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELQ04864 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELQ04864 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELQ04864 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELQ04864 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELQ04864 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELQ04864 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELQ04864 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELQ04864 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELQ04864 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELQ04864 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELQ04864 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELQ04864 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELQ04864 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELQ04864 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELQ04864 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RELQ04864 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELQ04864 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELQ04864 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELQ04864 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELQ04864 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELQ04864 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELQ04864 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELQ04864 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELQ04864 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELQ04864 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELQ04864 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELQ04864 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELQ04864 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELQ04864 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELQ04864 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELQ04864 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELQ04864 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELQ04864 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELQ04864 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELQ04864 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RELQ04864 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELQ04864 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELQ04864 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RELQ04864 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELQ04864 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RELQ04864 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELQ04864 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELQ04864 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELQ04864 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELQ04864 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELQ04864 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELQ04864 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELQ04864 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELQ04864 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELQ04864 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELQ04864 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELQ04864 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELQ04864 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELQ04864 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELQ04864 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELQ04864 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELQ04864 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELQ04864 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELQ04864 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RELQ04864 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms