Protein–RNA interactions for Protein: Q04749

AVO2, Target of rapamycin complex 2 subunit AVO2, yeastyeast

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVO2Q04749 CIC1YHR052W 1131 nt0.84□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 CUP1-1YHR053C 186 nt0.84□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 CUP1-2YHR055C 186 nt0.84□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 COX3Q0275 810 nt0.84□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 YJL022WYJL022W 309 nt0.84□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 PEP8YJL053W 1140 nt0.84□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 CTK3YML112W 891 nt0.84□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 YBL083CYBL083C 426 nt0.84□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 SMY1YKL079W 1971 nt0.84□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 AZF1YOR113W 2745 nt0.84□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 SNF5YBR289W 2718 nt0.84□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 SIP4YJL089W 2490 nt0.83□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 KAP122YGL016W 3246 nt0.83□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.83□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 LSM12YHR121W 564 nt0.83□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 COF1YLL050C 432 nt0.83□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 RTC6YPL183W-A 282 nt0.83□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 YJR098CYJR098C 1971 nt0.83□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 SMC1YFL008W 3678 nt0.82□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 VPS55YJR044C 423 nt0.82□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 HYM1YKL189W 1200 nt0.82□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt0.81□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 MVP1YMR004W 1536 nt0.81□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 MUK1YPL070W 1839 nt0.81□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt0.81□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 IRC19YLL033W 693 nt0.81□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 PKR1YMR123W 369 nt0.81□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 YJR029WYJR029W 5268 nt0.8□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.8□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 SEC3YER008C 4011 nt0.8□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 SGD1YLR336C 2700 nt0.8□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.8□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.8□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt0.8□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 HHT1YBR010W 411 nt0.8□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 YOR376WYOR376W 369 nt0.8□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 FMP23YBR047W 528 nt0.8□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 YBR224WYBR224W 516 nt0.8□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 PEP3YLR148W 2757 nt0.8□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 DGR2YKL121W 2559 nt0.8□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 DPB11YJL090C 2295 nt0.8□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 ROM2YLR371W 4071 nt0.79□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 YDR248CYDR248C 582 nt0.79□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 YDR250CYDR250C 276 nt0.79□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt0.79□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 RNR4YGR180C 1038 nt0.79□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 EMC5YIL027C 426 nt0.79□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 YPL080CYPL080C 327 nt0.79□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 YPR146CYPR146C 330 nt0.79□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 SHE4YOR035C 2370 nt0.79□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 IRR1YIL026C 3453 nt0.79□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 SEC5YDR166C 2916 nt0.78□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 snR59snR59 78 nt0.78□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 YDL068WYDL068W 330 nt0.78□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 IES5YER092W 378 nt0.78□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt0.78□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 DFG10YIL049W 762 nt0.78□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 CGI121YML036W 546 nt0.78□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 CLU1YMR012W 3834 nt0.78□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 YOL106WYOL106W 354 nt0.78□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 ERP4YOR016C 624 nt0.78□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 ATP15YPL271W 189 nt0.78□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 YPR063CYPR063C 423 nt0.78□□□□□ -2.28
AVO2Q04749 KIP1YBL063W 3336 nt0.77□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 UFD2YDL190C 2886 nt0.77□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 RTR2YDR066C 591 nt0.77□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 IRC2YDR112W 309 nt0.77□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 FSH1YHR049W 732 nt0.77□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 SPC1YJR010C-A 285 nt0.77□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 ABM1YJR108W 372 nt0.77□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 CMC1YKL137W 336 nt0.77□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 ARV1YLR242C 966 nt0.77□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 SEC22YLR268W 645 nt0.77□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 RPS18BYML026C 441 nt0.77□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 URA10YMR271C 684 nt0.77□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 YNL235CYNL235C 432 nt0.77□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 YPL039WYPL039W 951 nt0.77□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 SAG1YJR004C 1953 nt0.77□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 MAK10YEL053C 2202 nt0.77□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt0.76□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 OSH6YKR003W 1347 nt0.76□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt0.76□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 TDA2YER071C 381 nt0.76□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 RPL37AYLR185W 267 nt0.76□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 YBL073WYBL073W 312 nt0.76□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 snR14snR14 160 nt0.76□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 YOR364WYOR364W 369 nt0.76□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 NUP82YJL061W 2142 nt0.76□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 IML1YJR138W 4755 nt0.75□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 YDL211CYDL211C 1119 nt0.75□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 YDR115WYDR115W 318 nt0.75□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 LSO2YGR169C-A 279 nt0.75□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 LIN1YHR156C 1023 nt0.75□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt0.75□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.75□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 YLL054CYLL054C 2532 nt0.75□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 YBR184WYBR184W 1572 nt0.74□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 KAR3YPR141C 2190 nt0.74□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 SLS1YLR139C 1932 nt0.74□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 YER038W-AYER038W-A 381 nt0.74□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.7 ms