Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRB3Q04118 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms