Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREMQ03060 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREMQ03060 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREMQ03060 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CREMQ03060 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREMQ03060 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREMQ03060 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREMQ03060 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREMQ03060 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CREMQ03060 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREMQ03060 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREMQ03060 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREMQ03060 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREMQ03060 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREMQ03060 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREMQ03060 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREMQ03060 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREMQ03060 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREMQ03060 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREMQ03060 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREMQ03060 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREMQ03060 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREMQ03060 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREMQ03060 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREMQ03060 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREMQ03060 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CREMQ03060 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREMQ03060 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREMQ03060 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREMQ03060 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREMQ03060 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CREMQ03060 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREMQ03060 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREMQ03060 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREMQ03060 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREMQ03060 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREMQ03060 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREMQ03060 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREMQ03060 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREMQ03060 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREMQ03060 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREMQ03060 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREMQ03060 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CREMQ03060 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREMQ03060 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREMQ03060 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREMQ03060 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREMQ03060 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREMQ03060 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREMQ03060 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREMQ03060 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREMQ03060 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREMQ03060 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREMQ03060 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREMQ03060 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREMQ03060 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREMQ03060 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CREMQ03060 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREMQ03060 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREMQ03060 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREMQ03060 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREMQ03060 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREMQ03060 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREMQ03060 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREMQ03060 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREMQ03060 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREMQ03060 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CREMQ03060 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CREMQ03060 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREMQ03060 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREMQ03060 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREMQ03060 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREMQ03060 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREMQ03060 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CREMQ03060 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREMQ03060 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREMQ03060 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREMQ03060 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREMQ03060 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREMQ03060 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREMQ03060 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREMQ03060 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREMQ03060 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CREMQ03060 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREMQ03060 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREMQ03060 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREMQ03060 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREMQ03060 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREMQ03060 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREMQ03060 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREMQ03060 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREMQ03060 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREMQ03060 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CREMQ03060 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREMQ03060 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREMQ03060 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREMQ03060 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREMQ03060 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREMQ03060 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREMQ03060 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms