Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms