Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms