Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
MC1RQ01726 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms