Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms