Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNA1BQ00975 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms