Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms