Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms