Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN10P78369 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN10P78369 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN10P78369 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN10P78369 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN10P78369 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN10P78369 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN10P78369 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN10P78369 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN10P78369 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN10P78369 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN10P78369 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN10P78369 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN10P78369 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN10P78369 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN10P78369 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN10P78369 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN10P78369 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN10P78369 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN10P78369 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN10P78369 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms