Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms