Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms