Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms