Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP46P62068 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP46P62068 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP46P62068 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP46P62068 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP46P62068 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP46P62068 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP46P62068 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP46P62068 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP46P62068 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP46P62068 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP46P62068 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP46P62068 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP46P62068 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP46P62068 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP46P62068 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP46P62068 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP46P62068 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP46P62068 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP46P62068 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP46P62068 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP46P62068 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP46P62068 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP46P62068 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP46P62068 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP46P62068 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP46P62068 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP46P62068 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP46P62068 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP46P62068 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP46P62068 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP46P62068 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP46P62068 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP46P62068 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP46P62068 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP46P62068 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP46P62068 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP46P62068 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP46P62068 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP46P62068 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP46P62068 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP46P62068 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP46P62068 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP46P62068 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP46P62068 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP46P62068 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP46P62068 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP46P62068 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP46P62068 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP46P62068 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP46P62068 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP46P62068 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP46P62068 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP46P62068 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP46P62068 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP46P62068 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP46P62068 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP46P62068 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP46P62068 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP46P62068 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP46P62068 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP46P62068 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP46P62068 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP46P62068 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP46P62068 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP46P62068 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP46P62068 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP46P62068 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP46P62068 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP46P62068 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP46P62068 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP46P62068 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP46P62068 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP46P62068 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP46P62068 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP46P62068 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP46P62068 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP46P62068 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP46P62068 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP46P62068 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP46P62068 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP46P62068 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP46P62068 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP46P62068 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP46P62068 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP46P62068 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP46P62068 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP46P62068 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP46P62068 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP46P62068 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP46P62068 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP46P62068 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP46P62068 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP46P62068 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP46P62068 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP46P62068 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP46P62068 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP46P62068 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP46P62068 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP46P62068 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
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