Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME5P56597 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME5P56597 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME5P56597 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME5P56597 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME5P56597 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME5P56597 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME5P56597 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME5P56597 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME5P56597 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME5P56597 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME5P56597 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME5P56597 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NME5P56597 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NME5P56597 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME5P56597 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME5P56597 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME5P56597 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME5P56597 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME5P56597 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME5P56597 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME5P56597 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME5P56597 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME5P56597 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME5P56597 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME5P56597 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME5P56597 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME5P56597 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME5P56597 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NME5P56597 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME5P56597 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME5P56597 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME5P56597 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NME5P56597 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME5P56597 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME5P56597 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME5P56597 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NME5P56597 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME5P56597 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME5P56597 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NME5P56597 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME5P56597 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME5P56597 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME5P56597 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NME5P56597 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME5P56597 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME5P56597 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME5P56597 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME5P56597 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME5P56597 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME5P56597 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME5P56597 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME5P56597 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME5P56597 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME5P56597 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME5P56597 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NME5P56597 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME5P56597 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME5P56597 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME5P56597 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME5P56597 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME5P56597 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME5P56597 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME5P56597 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME5P56597 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME5P56597 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME5P56597 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME5P56597 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME5P56597 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME5P56597 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME5P56597 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME5P56597 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME5P56597 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME5P56597 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME5P56597 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME5P56597 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME5P56597 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME5P56597 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME5P56597 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME5P56597 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME5P56597 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME5P56597 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME5P56597 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME5P56597 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME5P56597 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME5P56597 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NME5P56597 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME5P56597 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME5P56597 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME5P56597 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME5P56597 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME5P56597 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME5P56597 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME5P56597 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME5P56597 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NME5P56597 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
NME5P56597 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NME5P56597 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NME5P56597 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NME5P56597 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms