Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms