Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms