Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YARSP54577 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YARSP54577 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YARSP54577 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YARSP54577 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YARSP54577 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YARSP54577 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
YARSP54577 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YARSP54577 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YARSP54577 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
YARSP54577 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YARSP54577 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YARSP54577 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YARSP54577 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YARSP54577 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YARSP54577 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YARSP54577 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YARSP54577 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YARSP54577 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YARSP54577 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YARSP54577 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YARSP54577 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
YARSP54577 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
YARSP54577 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
YARSP54577 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YARSP54577 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YARSP54577 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YARSP54577 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YARSP54577 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YARSP54577 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YARSP54577 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YARSP54577 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YARSP54577 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YARSP54577 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YARSP54577 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YARSP54577 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YARSP54577 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YARSP54577 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YARSP54577 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YARSP54577 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YARSP54577 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YARSP54577 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YARSP54577 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YARSP54577 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YARSP54577 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
YARSP54577 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YARSP54577 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YARSP54577 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YARSP54577 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
YARSP54577 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YARSP54577 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YARSP54577 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
YARSP54577 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
YARSP54577 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YARSP54577 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YARSP54577 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YARSP54577 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YARSP54577 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YARSP54577 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YARSP54577 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YARSP54577 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YARSP54577 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YARSP54577 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YARSP54577 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YARSP54577 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YARSP54577 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YARSP54577 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YARSP54577 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YARSP54577 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
YARSP54577 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YARSP54577 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YARSP54577 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YARSP54577 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YARSP54577 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
YARSP54577 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YARSP54577 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
YARSP54577 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YARSP54577 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
YARSP54577 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YARSP54577 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YARSP54577 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YARSP54577 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
YARSP54577 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YARSP54577 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YARSP54577 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YARSP54577 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YARSP54577 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YARSP54577 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YARSP54577 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YARSP54577 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
YARSP54577 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YARSP54577 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YARSP54577 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YARSP54577 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YARSP54577 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YARSP54577 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YARSP54577 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YARSP54577 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YARSP54577 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YARSP54577 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms