Protein–RNA interactions for Protein: P53819

YRF1-6, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 6, yeastyeast

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-6P53819 YPR142CYPR142C 564 nt0.65□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 DGR2YKL121W 2559 nt0.64□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 CUR1YPR158W 759 nt0.64□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 YML002WYML002W 2214 nt0.64□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 HOP2YGL033W 657 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 YJL049WYJL049W 1353 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 PRP39YML046W 1890 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 YGR250CYGR250C 2346 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 NOP10YHR072W-A 177 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 NSL1YPL233W 651 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 MGR1YCL044C 1254 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 UBC9YDL064W 474 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 GIC2YDR309C 1152 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 YLR458WYLR458W 381 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 AEP1YMR064W 1557 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 MVP1YMR004W 1536 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 BFA1YJR053W 1725 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 SLD5YDR489W 885 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 YER046W-AYER046W-A 330 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 RGI1YER067W 486 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 SVP26YHR181W 687 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 SEC8YPR055W 3198 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 AI4Q0065 1671 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 AHC2YCR082W 387 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 YDL157CYDL157C 357 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 DLT1YMR126C 1029 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 YOL050CYOL050C 321 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 AME1YBR211C 975 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 TRS20YBR254C 528 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 VAB2YEL005C 849 nt0.6□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 VPS25YJR102C 609 nt0.6□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 YNL010WYNL010W 726 nt0.6□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 ECM25YJL201W 1800 nt0.59□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 YGL177WYGL177W 348 nt0.59□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 YIP1YGR172C 747 nt0.59□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 NUP120YKL057C 3114 nt0.59□□□□□ -2.31
YRF1-6P53819 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 MAM1YER106W 909 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 PRS3YHL011C 963 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 RPI1YIL119C 1224 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 YNR021WYNR021W 1215 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 YOL150CYOL150C 312 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 YBR032WYBR032W 303 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 KAR9YPL269W 1935 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 DAS1YJL149W 1992 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 COG7YGL005C 840 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 FMP23YBR047W 528 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 COX6YHR051W 447 nt0.57□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.57□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 SGD1YLR336C 2700 nt0.57□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 NUR1YDL089W 1455 nt0.56□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.55□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 snR14snR14 160 nt0.55□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 GPI2YPL076W 843 nt0.55□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 SUT2YPR009W 807 nt0.55□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 CSE1YGL238W 2883 nt0.55□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 SMY1YKL079W 1971 nt0.55□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 MSC6YOR354C 2079 nt0.55□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 YBR051WYBR051W 351 nt0.54□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 TAP42YMR028W 1101 nt0.54□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 YET2YMR040W 483 nt0.54□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 FYV6YNL133C 522 nt0.54□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 PEX34YCL056C 435 nt0.54□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 NNF2YGR089W 2811 nt0.53□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 DUO1YGL061C 744 nt0.53□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 GIC1YHR061C 945 nt0.53□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 SDL1YIL167W 633 nt0.53□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 YJL114WYJL114W 681 nt0.53□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 LSM7YNL147W 348 nt0.53□□□□□ -2.32
YRF1-6P53819 HAL9YOL089C 3093 nt0.53□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 TIF11YMR260C 462 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 NUP188YML103C 4968 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 SLU7YDR088C 1149 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 HSK3YKL138C-A 210 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 YMR178WYMR178W 825 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 SNA4YDL123W 423 nt0.51□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 RPL40BYKR094C 387 nt0.51□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 IRC14YOR135C 342 nt0.51□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.51□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 YBR224WYBR224W 516 nt0.51□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 YLL054CYLL054C 2532 nt0.51□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 SEC5YDR166C 2916 nt0.51□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 RLM1YPL089C 2031 nt0.51□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 FAR7YFR008W 666 nt0.5□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 YLR031WYLR031W 561 nt0.5□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 YNL179CYNL179C 438 nt0.5□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 TMA20YER007C-A 546 nt0.5□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 PRM8YGL053W 714 nt0.5□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 YKE2YLR200W 345 nt0.5□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 YNL226WYNL226W 411 nt0.5□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 YLL007CYLL007C 1998 nt0.5□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 YDR262WYDR262W 819 nt0.49□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt0.49□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 STB6YKL072W 2301 nt0.48□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 COF1YLL050C 432 nt0.48□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 NEJ1YLR265C 1029 nt0.48□□□□□ -2.33
YRF1-6P53819 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.48□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.7 ms