Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
SMARCA2P51531 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms