Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAMP50895 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAMP50895 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAMP50895 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAMP50895 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAMP50895 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAMP50895 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAMP50895 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAMP50895 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAMP50895 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAMP50895 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAMP50895 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAMP50895 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAMP50895 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAMP50895 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAMP50895 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAMP50895 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAMP50895 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAMP50895 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAMP50895 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAMP50895 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAMP50895 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAMP50895 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAMP50895 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAMP50895 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAMP50895 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAMP50895 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAMP50895 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAMP50895 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAMP50895 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAMP50895 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAMP50895 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAMP50895 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAMP50895 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAMP50895 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAMP50895 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAMP50895 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAMP50895 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAMP50895 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAMP50895 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAMP50895 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAMP50895 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAMP50895 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAMP50895 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAMP50895 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAMP50895 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAMP50895 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAMP50895 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAMP50895 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAMP50895 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAMP50895 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAMP50895 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAMP50895 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAMP50895 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAMP50895 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAMP50895 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAMP50895 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAMP50895 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAMP50895 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAMP50895 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAMP50895 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAMP50895 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAMP50895 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAMP50895 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAMP50895 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAMP50895 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAMP50895 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAMP50895 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAMP50895 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAMP50895 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BCAMP50895 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BCAMP50895 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAMP50895 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAMP50895 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAMP50895 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAMP50895 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAMP50895 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAMP50895 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAMP50895 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAMP50895 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAMP50895 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAMP50895 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAMP50895 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAMP50895 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAMP50895 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAMP50895 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAMP50895 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAMP50895 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAMP50895 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAMP50895 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAMP50895 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAMP50895 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms