Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms