Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NESP48681 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NESP48681 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NESP48681 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NESP48681 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NESP48681 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NESP48681 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NESP48681 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
NESP48681 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
NESP48681 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
NESP48681 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NESP48681 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NESP48681 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NESP48681 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NESP48681 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NESP48681 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NESP48681 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NESP48681 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NESP48681 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NESP48681 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NESP48681 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NESP48681 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NESP48681 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NESP48681 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NESP48681 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
NESP48681 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NESP48681 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NESP48681 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
NESP48681 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NESP48681 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NESP48681 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
NESP48681 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
NESP48681 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
NESP48681 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
NESP48681 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NESP48681 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NESP48681 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NESP48681 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NESP48681 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NESP48681 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
NESP48681 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NESP48681 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NESP48681 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NESP48681 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NESP48681 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NESP48681 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NESP48681 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NESP48681 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NESP48681 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NESP48681 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NESP48681 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NESP48681 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NESP48681 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NESP48681 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NESP48681 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NESP48681 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NESP48681 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NESP48681 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NESP48681 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NESP48681 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NESP48681 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NESP48681 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NESP48681 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NESP48681 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NESP48681 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NESP48681 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NESP48681 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
NESP48681 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
NESP48681 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NESP48681 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NESP48681 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NESP48681 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NESP48681 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NESP48681 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NESP48681 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NESP48681 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NESP48681 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NESP48681 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NESP48681 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NESP48681 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NESP48681 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NESP48681 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NESP48681 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NESP48681 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NESP48681 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NESP48681 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NESP48681 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NESP48681 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NESP48681 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NESP48681 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
NESP48681 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NESP48681 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NESP48681 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NESP48681 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NESP48681 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NESP48681 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NESP48681 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NESP48681 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NESP48681 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NESP48681 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms