Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLCP48506 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLCP48506 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLCP48506 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLCP48506 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLCP48506 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLCP48506 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLCP48506 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLCP48506 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLCP48506 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLCP48506 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLCP48506 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLCP48506 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLCP48506 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLCP48506 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLCP48506 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLCP48506 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCLCP48506 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLCP48506 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLCP48506 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLCP48506 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLCP48506 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLCP48506 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLCP48506 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLCP48506 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLCP48506 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLCP48506 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLCP48506 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLCP48506 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLCP48506 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLCP48506 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLCP48506 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLCP48506 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLCP48506 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLCP48506 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCLCP48506 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCLCP48506 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCLCP48506 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCLCP48506 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCLCP48506 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCLCP48506 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCLCP48506 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCLCP48506 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCLCP48506 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GCLCP48506 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCLCP48506 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCLCP48506 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLCP48506 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLCP48506 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLCP48506 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLCP48506 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLCP48506 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLCP48506 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLCP48506 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLCP48506 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLCP48506 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLCP48506 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLCP48506 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLCP48506 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLCP48506 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLCP48506 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLCP48506 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLCP48506 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLCP48506 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCLCP48506 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCLCP48506 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCLCP48506 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCLCP48506 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCLCP48506 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCLCP48506 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCLCP48506 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCLCP48506 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCLCP48506 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCLCP48506 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCLCP48506 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCLCP48506 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCLCP48506 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCLCP48506 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCLCP48506 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCLCP48506 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCLCP48506 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCLCP48506 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GCLCP48506 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
GCLCP48506 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GCLCP48506 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GCLCP48506 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GCLCP48506 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GCLCP48506 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCLCP48506 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCLCP48506 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCLCP48506 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCLCP48506 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCLCP48506 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCLCP48506 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCLCP48506 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCLCP48506 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCLCP48506 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCLCP48506 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCLCP48506 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCLCP48506 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms