Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA8P48165 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA8P48165 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA8P48165 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA8P48165 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA8P48165 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA8P48165 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA8P48165 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA8P48165 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA8P48165 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA8P48165 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA8P48165 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA8P48165 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA8P48165 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA8P48165 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA8P48165 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA8P48165 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA8P48165 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA8P48165 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA8P48165 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA8P48165 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA8P48165 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA8P48165 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA8P48165 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA8P48165 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA8P48165 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA8P48165 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA8P48165 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA8P48165 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA8P48165 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA8P48165 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA8P48165 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA8P48165 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA8P48165 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA8P48165 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA8P48165 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA8P48165 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA8P48165 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA8P48165 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA8P48165 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA8P48165 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GJA8P48165 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
GJA8P48165 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA8P48165 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA8P48165 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA8P48165 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA8P48165 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA8P48165 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA8P48165 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA8P48165 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA8P48165 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA8P48165 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA8P48165 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA8P48165 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA8P48165 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA8P48165 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA8P48165 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA8P48165 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA8P48165 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA8P48165 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA8P48165 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA8P48165 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA8P48165 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA8P48165 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA8P48165 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA8P48165 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA8P48165 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA8P48165 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA8P48165 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA8P48165 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA8P48165 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA8P48165 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA8P48165 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA8P48165 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA8P48165 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA8P48165 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA8P48165 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA8P48165 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA8P48165 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA8P48165 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA8P48165 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA8P48165 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA8P48165 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA8P48165 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA8P48165 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA8P48165 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA8P48165 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA8P48165 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA8P48165 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA8P48165 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA8P48165 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA8P48165 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA8P48165 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA8P48165 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA8P48165 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA8P48165 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA8P48165 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA8P48165 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA8P48165 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA8P48165 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms