Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME1P48163 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME1P48163 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME1P48163 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME1P48163 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME1P48163 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME1P48163 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME1P48163 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME1P48163 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME1P48163 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ME1P48163 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ME1P48163 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME1P48163 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME1P48163 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME1P48163 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME1P48163 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME1P48163 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME1P48163 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME1P48163 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME1P48163 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME1P48163 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME1P48163 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME1P48163 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME1P48163 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME1P48163 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME1P48163 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME1P48163 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME1P48163 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME1P48163 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME1P48163 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME1P48163 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME1P48163 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME1P48163 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME1P48163 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME1P48163 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME1P48163 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME1P48163 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME1P48163 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME1P48163 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME1P48163 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME1P48163 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME1P48163 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME1P48163 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME1P48163 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME1P48163 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME1P48163 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME1P48163 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME1P48163 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME1P48163 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME1P48163 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME1P48163 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME1P48163 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME1P48163 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME1P48163 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME1P48163 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME1P48163 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME1P48163 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME1P48163 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME1P48163 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME1P48163 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME1P48163 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME1P48163 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ME1P48163 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME1P48163 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME1P48163 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME1P48163 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME1P48163 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ME1P48163 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME1P48163 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME1P48163 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME1P48163 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME1P48163 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms