Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MLH1P40692 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH1P40692 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH1P40692 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH1P40692 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH1P40692 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH1P40692 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH1P40692 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH1P40692 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH1P40692 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH1P40692 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH1P40692 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH1P40692 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH1P40692 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH1P40692 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH1P40692 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH1P40692 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH1P40692 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH1P40692 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH1P40692 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH1P40692 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH1P40692 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH1P40692 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH1P40692 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH1P40692 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH1P40692 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH1P40692 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH1P40692 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH1P40692 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH1P40692 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH1P40692 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH1P40692 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH1P40692 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH1P40692 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH1P40692 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH1P40692 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH1P40692 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH1P40692 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH1P40692 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH1P40692 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH1P40692 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH1P40692 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH1P40692 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH1P40692 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH1P40692 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH1P40692 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH1P40692 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH1P40692 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH1P40692 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH1P40692 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH1P40692 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH1P40692 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH1P40692 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH1P40692 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLH1P40692 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLH1P40692 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLH1P40692 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLH1P40692 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLH1P40692 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLH1P40692 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLH1P40692 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MLH1P40692 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLH1P40692 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MLH1P40692 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLH1P40692 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLH1P40692 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLH1P40692 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLH1P40692 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLH1P40692 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLH1P40692 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLH1P40692 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLH1P40692 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLH1P40692 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLH1P40692 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MLH1P40692 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MLH1P40692 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MLH1P40692 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MLH1P40692 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MLH1P40692 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MLH1P40692 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MLH1P40692 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MLH1P40692 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MLH1P40692 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MLH1P40692 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MLH1P40692 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MLH1P40692 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MLH1P40692 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MLH1P40692 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MLH1P40692 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MLH1P40692 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MLH1P40692 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MLH1P40692 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MLH1P40692 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MLH1P40692 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MLH1P40692 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MLH1P40692 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MLH1P40692 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MLH1P40692 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MLH1P40692 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MLH1P40692 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms