Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTRLP40313 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTRLP40313 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTRLP40313 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTRLP40313 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTRLP40313 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTRLP40313 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTRLP40313 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTRLP40313 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTRLP40313 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTRLP40313 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTRLP40313 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTRLP40313 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTRLP40313 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTRLP40313 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTRLP40313 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTRLP40313 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTRLP40313 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTRLP40313 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTRLP40313 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTRLP40313 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTRLP40313 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTRLP40313 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTRLP40313 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTRLP40313 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTRLP40313 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTRLP40313 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTRLP40313 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTRLP40313 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTRLP40313 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTRLP40313 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTRLP40313 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTRLP40313 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTRLP40313 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTRLP40313 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTRLP40313 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTRLP40313 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTRLP40313 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTRLP40313 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTRLP40313 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTRLP40313 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTRLP40313 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTRLP40313 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTRLP40313 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTRLP40313 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTRLP40313 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTRLP40313 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTRLP40313 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTRLP40313 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTRLP40313 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTRLP40313 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTRLP40313 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTRLP40313 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTRLP40313 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTRLP40313 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTRLP40313 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTRLP40313 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRLP40313 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRLP40313 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTRLP40313 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRLP40313 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRLP40313 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRLP40313 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRLP40313 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRLP40313 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRLP40313 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRLP40313 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTRLP40313 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTRLP40313 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms