Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms