Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT2P35908 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT2P35908 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT2P35908 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT2P35908 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT2P35908 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT2P35908 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT2P35908 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT2P35908 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT2P35908 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT2P35908 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT2P35908 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT2P35908 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT2P35908 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT2P35908 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT2P35908 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT2P35908 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT2P35908 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT2P35908 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT2P35908 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT2P35908 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT2P35908 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT2P35908 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT2P35908 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT2P35908 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT2P35908 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT2P35908 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT2P35908 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT2P35908 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT2P35908 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT2P35908 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT2P35908 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT2P35908 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT2P35908 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT2P35908 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT2P35908 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT2P35908 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT2P35908 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT2P35908 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT2P35908 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT2P35908 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT2P35908 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT2P35908 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT2P35908 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT2P35908 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT2P35908 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT2P35908 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT2P35908 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT2P35908 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT2P35908 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT2P35908 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT2P35908 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT2P35908 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT2P35908 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT2P35908 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT2P35908 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT2P35908 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT2P35908 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT2P35908 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT2P35908 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT2P35908 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT2P35908 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT2P35908 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT2P35908 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT2P35908 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT2P35908 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT2P35908 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT2P35908 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT2P35908 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT2P35908 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT2P35908 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT2P35908 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT2P35908 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT2P35908 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT2P35908 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT2P35908 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT2P35908 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT2P35908 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT2P35908 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT2P35908 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT2P35908 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT2P35908 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT2P35908 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT2P35908 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT2P35908 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT2P35908 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT2P35908 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT2P35908 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT2P35908 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT2P35908 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT2P35908 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT2P35908 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT2P35908 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT2P35908 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT2P35908 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT2P35908 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT2P35908 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT2P35908 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT2P35908 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT2P35908 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms