Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYH11P35749 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYH11P35749 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYH11P35749 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYH11P35749 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MYH11P35749 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYH11P35749 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYH11P35749 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYH11P35749 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYH11P35749 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYH11P35749 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYH11P35749 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYH11P35749 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYH11P35749 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYH11P35749 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH11P35749 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH11P35749 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH11P35749 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH11P35749 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH11P35749 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH11P35749 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH11P35749 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH11P35749 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH11P35749 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH11P35749 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH11P35749 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH11P35749 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH11P35749 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH11P35749 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH11P35749 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH11P35749 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH11P35749 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH11P35749 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH11P35749 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH11P35749 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH11P35749 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH11P35749 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH11P35749 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH11P35749 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH11P35749 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH11P35749 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH11P35749 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH11P35749 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH11P35749 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH11P35749 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH11P35749 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH11P35749 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH11P35749 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH11P35749 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH11P35749 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH11P35749 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH11P35749 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH11P35749 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH11P35749 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH11P35749 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH11P35749 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH11P35749 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH11P35749 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH11P35749 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH11P35749 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH11P35749 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH11P35749 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH11P35749 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH11P35749 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH11P35749 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH11P35749 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH11P35749 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH11P35749 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH11P35749 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH11P35749 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH11P35749 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH11P35749 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH11P35749 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH11P35749 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH11P35749 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH11P35749 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH11P35749 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH11P35749 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH11P35749 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH11P35749 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH11P35749 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH11P35749 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH11P35749 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH11P35749 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH11P35749 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH11P35749 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH11P35749 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH11P35749 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH11P35749 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH11P35749 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH11P35749 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH11P35749 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH11P35749 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH11P35749 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH11P35749 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH11P35749 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH11P35749 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH11P35749 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH11P35749 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH11P35749 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms