Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NF2P35240 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NF2P35240 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NF2P35240 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NF2P35240 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NF2P35240 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NF2P35240 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NF2P35240 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NF2P35240 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NF2P35240 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NF2P35240 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NF2P35240 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NF2P35240 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NF2P35240 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NF2P35240 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NF2P35240 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NF2P35240 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NF2P35240 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NF2P35240 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NF2P35240 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NF2P35240 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NF2P35240 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NF2P35240 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NF2P35240 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NF2P35240 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NF2P35240 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NF2P35240 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NF2P35240 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NF2P35240 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NF2P35240 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NF2P35240 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NF2P35240 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NF2P35240 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NF2P35240 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NF2P35240 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NF2P35240 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NF2P35240 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NF2P35240 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NF2P35240 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NF2P35240 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NF2P35240 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NF2P35240 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NF2P35240 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NF2P35240 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NF2P35240 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NF2P35240 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NF2P35240 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NF2P35240 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NF2P35240 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NF2P35240 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NF2P35240 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NF2P35240 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NF2P35240 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NF2P35240 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NF2P35240 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NF2P35240 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NF2P35240 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NF2P35240 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NF2P35240 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NF2P35240 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NF2P35240 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NF2P35240 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NF2P35240 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NF2P35240 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NF2P35240 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NF2P35240 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NF2P35240 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NF2P35240 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NF2P35240 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NF2P35240 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NF2P35240 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NF2P35240 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NF2P35240 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NF2P35240 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NF2P35240 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NF2P35240 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NF2P35240 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NF2P35240 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NF2P35240 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NF2P35240 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NF2P35240 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NF2P35240 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NF2P35240 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NF2P35240 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NF2P35240 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NF2P35240 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NF2P35240 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NF2P35240 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NF2P35240 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NF2P35240 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NF2P35240 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NF2P35240 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NF2P35240 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NF2P35240 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NF2P35240 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NF2P35240 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NF2P35240 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NF2P35240 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NF2P35240 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NF2P35240 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms