Protein–RNA interactions for Protein: P34077

NIC96, Nucleoporin NIC96, yeastyeast

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIC96P34077 ESL2YKR096W 3588 nt2.59□□□□□ -2
NIC96P34077 TRA1YHR099W 11235 nt2.59□□□□□ -2
NIC96P34077 YIL174WYIL174W 228 nt2.58□□□□□ -2
NIC96P34077 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.58□□□□□ -2
NIC96P34077 YAF9YNL107W 681 nt2.58□□□□□ -2
NIC96P34077 YBL108WYBL108W 306 nt2.58□□□□□ -2
NIC96P34077 TCB2YNL087W 3537 nt2.58□□□□□ -2
NIC96P34077 VPS64YDR200C 1815 nt2.58□□□□□ -2
NIC96P34077 CRM1YGR218W 3255 nt2.57□□□□□ -2
NIC96P34077 YHR078WYHR078W 1659 nt2.57□□□□□ -2
NIC96P34077 YKL118WYKL118W 312 nt2.57□□□□□ -2
NIC96P34077 YKR033CYKR033C 426 nt2.57□□□□□ -2
NIC96P34077 EMC6YLL014W 327 nt2.57□□□□□ -2
NIC96P34077 YLR012CYLR012C 300 nt2.57□□□□□ -2
NIC96P34077 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.57□□□□□ -2
NIC96P34077 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt2.57□□□□□ -2
NIC96P34077 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.56□□□□□ -2
NIC96P34077 RPL23BYER117W 414 nt2.56□□□□□ -2
NIC96P34077 APC9YLR102C 798 nt2.56□□□□□ -2
NIC96P34077 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt2.56□□□□□ -2
NIC96P34077 YPR146CYPR146C 330 nt2.56□□□□□ -2
NIC96P34077 YJR003CYJR003C 1560 nt2.56□□□□□ -2
NIC96P34077 MET18YIL128W 3099 nt2.55□□□□□ -2
NIC96P34077 NHP2YDL208W 471 nt2.55□□□□□ -2
NIC96P34077 YGL024WYGL024W 336 nt2.55□□□□□ -2
NIC96P34077 RPL14BYHL001W 417 nt2.55□□□□□ -2
NIC96P34077 RIC1YLR039C 3171 nt2.55□□□□□ -2
NIC96P34077 SIR3YLR442C 2937 nt2.55□□□□□ -2
NIC96P34077 PRE8YML092C 753 nt2.55□□□□□ -2
NIC96P34077 RTT10YPL183C 3042 nt2.55□□□□□ -2
NIC96P34077 YPL238CYPL238C 390 nt2.55□□□□□ -2
NIC96P34077 SPO22YIL073C 2928 nt2.55□□□□□ -2
NIC96P34077 HMF1YER057C 390 nt2.54□□□□□ -2
NIC96P34077 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.54□□□□□ -2
NIC96P34077 YHL037CYHL037C 402 nt2.54□□□□□ -2
NIC96P34077 MAM33YIL070C 801 nt2.54□□□□□ -2
NIC96P34077 UTP30YKR060W 825 nt2.54□□□□□ -2
NIC96P34077 RPS17AYML024W 411 nt2.54□□□□□ -2
NIC96P34077 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.54□□□□□ -2
NIC96P34077 PSD2YGR170W 3417 nt2.54□□□□□ -2
NIC96P34077 SGM1YJR134C 2124 nt2.54□□□□□ -2
NIC96P34077 YDL152WYDL152W 366 nt2.53□□□□□ -2
NIC96P34077 YRB1YDR002W 606 nt2.53□□□□□ -2
NIC96P34077 YER097WYER097W 330 nt2.52□□□□□ -2.01
NIC96P34077 ERP6YGL002W 651 nt2.52□□□□□ -2.01
NIC96P34077 CDC27YBL084C 2277 nt2.51□□□□□ -2.01
NIC96P34077 YFH1YDL120W 525 nt2.51□□□□□ -2.01
NIC96P34077 YDR413CYDR413C 576 nt2.51□□□□□ -2.01
NIC96P34077 PAU14YIL176C 363 nt2.51□□□□□ -2.01
NIC96P34077 PAU1YJL223C 363 nt2.51□□□□□ -2.01
NIC96P34077 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt2.51□□□□□ -2.01
NIC96P34077 TIM18YOR297C 579 nt2.51□□□□□ -2.01
NIC96P34077 BCK1YJL095W 4437 nt2.51□□□□□ -2.01
NIC96P34077 IRA2YOL081W 9240 nt2.51□□□□□ -2.01
NIC96P34077 UBR1YGR184C 5853 nt2.5□□□□□ -2.01
NIC96P34077 AXL1YPR122W 3627 nt2.5□□□□□ -2.01
NIC96P34077 YDR286CYDR286C 345 nt2.5□□□□□ -2.01
NIC96P34077 QCR7YDR529C 384 nt2.5□□□□□ -2.01
NIC96P34077 TIM9YEL020W-A 264 nt2.5□□□□□ -2.01
NIC96P34077 HYP2YEL034W 474 nt2.5□□□□□ -2.01
NIC96P34077 YOR333CYOR333C 417 nt2.5□□□□□ -2.01
NIC96P34077 CSF1YLR087C 8877 nt2.5□□□□□ -2.01
NIC96P34077 YPR097WYPR097W 3222 nt2.49□□□□□ -2.01
NIC96P34077 SWR1YDR334W 4545 nt2.49□□□□□ -2.01
NIC96P34077 YDR102CYDR102C 333 nt2.49□□□□□ -2.01
NIC96P34077 YGL069CYGL069C 465 nt2.49□□□□□ -2.01
NIC96P34077 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.49□□□□□ -2.01
NIC96P34077 YAR053WYAR053W 297 nt2.49□□□□□ -2.01
NIC96P34077 YPL182CYPL182C 384 nt2.49□□□□□ -2.01
NIC96P34077 PHO2YDL106C 1680 nt2.49□□□□□ -2.01
NIC96P34077 CLN3YAL040C 1743 nt2.48□□□□□ -2.01
NIC96P34077 YCR022CYCR022C 345 nt2.48□□□□□ -2.01
NIC96P34077 MRP10YDL045W-A 288 nt2.48□□□□□ -2.01
NIC96P34077 YLR149CYLR149C 2193 nt2.48□□□□□ -2.01
NIC96P34077 BUB1YGR188C 3066 nt2.48□□□□□ -2.01
NIC96P34077 MGM1YOR211C 2646 nt2.48□□□□□ -2.01
NIC96P34077 MNE1YOR350C 1992 nt2.47□□□□□ -2.01
NIC96P34077 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.47□□□□□ -2.01
NIC96P34077 STB4YMR019W 2850 nt2.47□□□□□ -2.01
NIC96P34077 YGL239CYGL239C 315 nt2.46□□□□□ -2.02
NIC96P34077 YML037CYML037C 1023 nt2.46□□□□□ -2.02
NIC96P34077 COX14YML129C 213 nt2.46□□□□□ -2.02
NIC96P34077 KTI11YBL071W-A 249 nt2.46□□□□□ -2.02
NIC96P34077 BIL1YOR304C-A 231 nt2.46□□□□□ -2.02
NIC96P34077 NOT5YPR072W 1683 nt2.46□□□□□ -2.02
NIC96P34077 MLH1YMR167W 2310 nt2.46□□□□□ -2.02
NIC96P34077 SCH9YHR205W 2475 nt2.45□□□□□ -2.02
NIC96P34077 YDR366CYDR366C 399 nt2.45□□□□□ -2.02
NIC96P34077 DOT6YER088C 2013 nt2.45□□□□□ -2.02
NIC96P34077 VPH1YOR270C 2523 nt2.45□□□□□ -2.02
NIC96P34077 SMY1YKL079W 1971 nt2.45□□□□□ -2.02
NIC96P34077 VPS8YAL002W 3825 nt2.45□□□□□ -2.02
NIC96P34077 RPO41YFL036W 4056 nt2.44□□□□□ -2.02
NIC96P34077 RAV1YJR033C 4074 nt2.44□□□□□ -2.02
NIC96P34077 snR65snR65 100 nt2.44□□□□□ -2.02
NIC96P34077 WIP1YDR374W-A 270 nt2.44□□□□□ -2.02
NIC96P34077 YFL032WYFL032W 321 nt2.44□□□□□ -2.02
NIC96P34077 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt2.44□□□□□ -2.02
NIC96P34077 YPR099CYPR099C 357 nt2.44□□□□□ -2.02
NIC96P34077 YBR224WYBR224W 516 nt2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.1 ms